O Conselho Diretor (Condir) é o órgão máximo do Inea. Ele é composto pelos titulares da Presidência, Vice-Presidência e Diretorias (Diretoria de Licenciamento Ambiental; Diretoria Socioambiental; Diretoria de Segurança Hídrica e Qualidade Ambiental; Diretoria de Recuperação Ambiental; Diretoria de Biodiversidade e Áreas Protegidas e Diretoria de Administração e Finanças).

As reuniões do Condir acontecem, ordinariamente, no mínimo uma vez por mês, para tratar de assuntos estratégicos, técnicos e administrativos do Instituto (Reunião de Assuntos Gerais), bem como para deliberar sobre processos de Licenciamento Ambiental (Reunião de Licenciamento Ambiental).

O Conselho pode se reunir ainda em caráter extraordinário por convocação do Presidente, do Vice-Presidente, ou por convocação conjunta de dois ou mais diretores para debater assuntos excepcionais que demandem solução imediata.

As reuniões deliberativas de Licenciamento Ambiental são públicas e suas pautas e atas estão disponíveis aqui no portal.